运输船位于要塞之内，主要包括通信飞船和运输飞船。
传送室：一般来说，传送室分布于基地的四个位置，它们是要塞和舰队间往来的主要手段，大多数时候，一号传送室则用于接收访客。
起降平台：属于战团的大多数飞行器都会被安置在起降平台的悬挂架上，包括战斗机，大型运输机和高速侦察机。
军械库：这座巨大地下建筑群用于储存武器和弹药，整个建筑群的安全由铸造大师负责，军械库只有他在场时才能进入，开启大门需要他的基因印记和加密信号，只有在在紧急情况下战团指挥官才可以通过口述机要密码进行越权操作。
药剂室：这里包含所有用作医疗、研究和生化实验室的建筑，也是将凡人通过手术改造为超人的地方，而在药剂室上方是熟练的医务人员的私人区域，而在低层是仆从和护士们的宿舍。
集会大厅：通常是整个修道院要塞最大的区域，拥有又高又阔的穹顶，可供整个战团集合，主要用于大型会议，祭典，宗教节日和特殊宴会。
圣物室：它一般开辟在集会室的一隅，专门用于祭仪活动，虔诚的牧师长管理着圣物室，那里面保存了战团的神圣遗物，以及很多最珍贵的战利品。
餐厅：该区域是主要用于进餐，包括厨房，贮存室，处置单位和净化槽，修士们到场后一般先进行感恩祈祷，然后安静的用餐（太空野狼除外）。
宣讲室：整个修道院中分布着若干间宣讲室，用于私人会议、教学、简报和小型集会。
智库档案馆：这是属于战团内灵能者们的私人领域，里面不仅收藏了典籍，还是中心记录储存室和主要通信室，战团的星语者将大多数时间都花费在这里，监控并广播来自基地的信息，智库馆长全面负责记录历史，基地内部和外部通信，以及基地防御。
这些防御设施通过档案馆内的武备室进行控制，室内还有通信主官和多名智库、星语者以及技术支持人员。
典籍室：这里是修士们查询信息的地方，也是新兵们主要的学习场所，在这里可直接访问未加密的智库文件，通过电脑终端进行访问，并允许使用者选择，翻阅，向主智库中录入新条目。
静室：这是修道院里最安静的区域，为修士提供静思之所，寻求提升或者心怀困惑的修士
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