将颜颐寿、刘玉、王启、刘文庄、汤沐、顾佖、汪渊并聂贤、徐文华及江潮等，同各犯俱下三法司，署印官用刑推究，又原问官具言马录主张，所主何意。
同时，为了防止舞弊，嘉靖令璁摄都察院、桂萼摄刑部、方献夫摄大理寺，审理张寅案。经过一番审讯，对张寅家族谱系及其亲属关系理清后，又查得成化十八年山西黄册内有李福达名字，彼时方七岁，至弘治二年王良、李钺谋反时，方十四岁，岂有谋反充军山丹卫之说也，计今嘉靖六年李福达年五十二，今张寅年已六十七，发就种种矣，何得以张寅即李福达也？
须发尽白的张寅比崞县李福达大出十五岁。并搜马录箧中有大学士贾咏、御史张英、都御史张仲贤、大理寺丞汪渊、工部侍郎闵楷私书，与马录等人所勾连的官员也大多浮出水面，最终具得张寅被诬状，使马录等缔党陷害张寅一家的罪行暴露无遗，张璁等对该案依法进行了判决。九月初七日，经世宗同意，后来，又将张寅案先后会问招稿集订为一书，名《钦明大狱录》颁布于世，以示刑罚之公。
此案，最后由嘉靖亲自处理，处罚之重，不亚于左顺门。
原告薛良判处死刑，为他作证的证人全部戍边，张寅官复原职。马录陷人死罪但未得逞，判处徒刑。其他涉及此案被处理的各级官员有四十余人。
谪戍边疆，终生不赦的五人：前山西布政使李璋、按察使李珏、佥事章纶、都指挥马豸、前山西副使改任大理少卿的文华；谪戍边境卫所的七人：给事中刘琦、张逵、常泰，御史卢琼、程启充，刑部郎中刘仕及知州胡伟。
削职为民的十一人：左都御史聂贤，给事中王科、郑一鹏、沈汉、程辂，御史高世魁、任淳，南京御史姚鸣凤，郎中司马相，评事杜鸾。
革职赋闲的十七人：刑部尚书颜颐寿，侍郎刘玉、王启，山西巡抚江潮，副都御史刘文庄，大理卿汤沐，大理少卿顾学，大理寺丞汪渊，太仆卿汪元锡，光禄少卿余才，工部侍郎闵楷，都御史张仲贤、佥都御史张润，御史张英，南京御史潘杜、戚雄，由大理寺丞改任佥都御史的毛伯温。
尚书、侍郎级的高官甚至比左顺门之变牵连的更加多，成为嘉靖初年的大案之一。
所有本朝一旦涉及白莲教，都是极为慎重的，即便像陆炳这样极得嘉靖信任的臣子，也要非常小心谨慎，免得触碰到嘉
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