不同的老师，最终做了决定，吃下了药丸。药丸一下肚，就感觉身体里有什么东西松动了，一双眼睛变为金黄，世界都变得陌生了。
其实药丸里是一个小型的s2机关，也就是生命果实，是人类不曾拥有的力量，现在明日香就是一个小使徒。
“很好，以后你的同步率就会一点点升高，最后就会超过碇真嗣同学。”如果一下子升高就太突兀了，太不科学了，如果一点点升高就没问题了。
明日香感觉好极了，那么接下来的三号机启动试验正好可以试试看。明日香被选中成为了三号机的启动驾驶员。
启动试验一般都很危险，因为初号机和二号机的启动试验都是直接把驾驶员吞了。明日香虽然并不知道这些历史，但也知道启动试验不是一般的试验，并不能确保百分之一百的安全。她想到自己肯定是被抛弃了，不然不会选择自己做这种危险的事情。
心态不太好，不过现在明日香已经觉醒，所以肺腑一番后就决定一定要让所有人都看看自己的实力。不就是启动试验么？她就要让三号机动起来。
在tv版本里三号机的驾驶员是碇真嗣的好基友铃原东治，剧场版里换成了明日香。不过结果都差不多，都是三号机被使徒侵蚀暴走。初号机迎击，但碇真嗣却不想伤害朋友，最后碇源堂启动傀儡系统打碎了三号机，最后甚至咬碎了插入栓。
杜兰认为碇真嗣根本没有必要拒绝，因为他一拒绝，事情就会变得更糟糕。本来他要是控制一点，插入栓至少不会被咬碎。
当然也可能是少年根本没有控制战斗损失的能力，没学过，或许少年出手造成的破坏比傀儡系统还大。
总之现在二号机被封存了起来，明日香要去驾驶三号机了。
插入栓里的明日香只感觉一阵强有力的推背感，就被使徒推着进入了意识的深处。光谱分析变为了蓝色，三号机被定义为了使徒。
“是侵入型的使徒？”赤木律子立刻怀疑三号机已经被入侵了，使徒就在三号机体内。
葛城美里紧张地说道：“弹出插入栓。”
程序启动，但插入式卡在半路，因为三号机的盔甲之间长出了皮肤一样的胶质物，拉住了弹射仓，插入栓就卡在脖子后面，弹射不出来。
“明日香？”葛城美里立刻知道少女要危险了
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