原暗宇宙终结制造出来的剧烈爆炸，几乎像是在地球上啃了一口，整个第三新东京都彻底被抹除，甚至连本周岛都已经变成了一处巨大的海沟，或者应该说是海底盆地。罊
在这样的爆炸之中，能够幸存下来的，也只有真正最为强大的存在，比如说初号机和登上了其他EVA的驾驶员。
碇真嗣是少数在爆炸之后还能保持清醒的人，他在爆炸之中，凭借着自己无比强悍心灵之光，保护了总部之中所有的核心成员，包括其他两台EVA在爆炸的后半阶段都陷入昏迷之中，如果不是他将基因锁解开到最巅峰，恐怕也会湮灭在那爆炸之中。
但即便保护了总部中的核心人员，剧烈的爆炸带来的伤亡依旧是可以预见的，首先整个第三新东京就消失了，碇真嗣曾经的同学们，包括这座城市中的每一个人，恐怕都已经灰飞烟灭。
而根据这爆炸的威力，可以轻而易举的推算出，受灾范围究竟有多大，这一刻，他甚至不希望自己有那么强的计算能力，可以一瞬间推算出爆炸产生的破坏。
将有数十亿人在这场天灾中丧生，即便是第二次冲击的时候，也从未造成过如此惨烈的伤亡，这一切都是一场莫名其妙的爆炸造成的。
碇真嗣第一次觉得自己无法接受现实，那些自己想要保护的人，那些曾经和自己朝夕相处的人，现在全都死了。
“大叔……你究竟在做什么？你不是说一切都是可以挽回的吗？可是……啊啊啊啊！”即便是这一世已经变得无比坚强的碇真嗣，在眼睁睁的看着半个世界被毁灭，而自己却无能为力后，也近乎崩溃。罊
“不！一定要挽回这一切，这一切都是假的，这一切都没有发生过。”强烈的念头在他的心底回响着，随之化为在现实之中也能展现出来的强大力量。
初号机强大的心灵之光开始出现异变，在初号机的背后，一个明亮的白色光环正在成型，光环不断扩大，最终缓缓移动到了初号机的头顶，正如同一个天使的光环一般。
这一幕的发生似乎是终于惊动了零号机之中昏迷的绫波丽，她对于其他的人类的死并没有多大的触动，但看向初号机的方向，却被碇真嗣所展现出来的情感所触动，或许这种时候自己是该帮对方一把了。
初号机有了S2核心，只差莉莉丝的灵魂
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