为了有效治理西域故土，唐太宗当即下令，在高昌故地设置西州，将其正式划为大唐行政区域。同时设立安西都护府，这是大唐在西域设立的核心军政机构，肩负着镇守西域、安抚诸国、管理商贸、抵御外敌的重任。都护府的治所，便设于交河城中，城墙之上，大唐的旌旗猎猎作响。
朝廷任命郭孝恪为安西都护、西州刺史。郭孝恪，许州阳翟人，早年追随李世民，以骁勇善战、治理有方著称。他驻守西州，推行大唐政令，丈量土地，编户齐民，恢复因战乱而中断的灌溉系统；安抚当地百姓，胡汉一视同仁，尊重其风俗习惯；更重修驿道，设置烽燧，让丝绸之路再次畅通无阻。西域诸国闻高昌平、安西立，纷纷遣使来朝，龟兹献乐，于阗贡玉，碎叶城的商队再次驼铃悠扬。